蚊香的主要成分为少量杀虫农药，包括有机磷类、氨基甲酸酯类和菊酯类。其中有机磷类毒性最大，菊酯类毒性最弱。大多数蚊香的有效成分是菊酯类杀虫剂，市场上90%以上的蚊香含有菊酯类杀虫剂，它是国家允许使用的一种低毒高效杀虫剂，在蚊香中有规定使用比例。传统蚊香烟雾中含有细颗粒物、多环芳香烃、羰基化合物和苯，虽然可能对人体产生威胁，鉴于含量小，合理使用基本无害。需要注意的是，蚊香的烟雾可能导致过敏反应，诱发哮喘发作，有这类疾病者应慎用。
如果在密闭的房间内放置超量的蚊香，可能会引起头晕、头痛、恶心、视物模糊、呼吸困难等中毒症状。建议在15平方米的房间内放一盘蚊香即可。为了安全起见，点燃的蚊香最好不要放在头部附近，以减少吸入烟雾。傍晚时分、天黑前是使用蚊香的好时机，使用时门窗紧闭，人及宠物都要离开，之后再开窗通风。